原发性脊髓胶质瘤(SCA)是一种罕见的疾病，占所有原发性中枢神经系统肿瘤的2-4%，其中，SCA约占所有原发性脊髓胶质瘤的30-40%。

与可以使用标准指南治疗的脑胶质瘤相反，SCA迄今尚未建立标准治疗方案，因此原发性SCA患者的治疗具有较大的挑战性。在手术治疗中，SCA与正常脊髓之间没有明确的界限，因此限制了手术切除原发SCA的有效性，并且重新利用脑胶质瘤的辅助治疗策略并没有显示出原发SCA的同等生存改善。因此，SCA治疗的未来将取决于新的靶向药物或其他类型的精准医疗策略，如嵌合抗原受体T细胞(CART)。

为开发新的靶向治疗策略铺平道路，更好地了解原发性SCA的分子特征至关重要。目前对SCAs的理解主要基于颅内胶质瘤的分子研究，原发性SCA在分子水平上的理解很少，这种疾病的驱动因素尚未完全阐明。

最近，人们对典型癌症相关基因的突变谱进行了研究，发现H3F3A、TP53和ATRX基因是最常见的突变基因，在20%的SCAs中发现了H3F3A^K27M突变。Lebrun等人对SCAs进行的最大的靶向基因组研究，使用下一代测序评估了61例患者的33个胶质瘤相关基因。他们发现，参与MAPK信号通路的基因的改变在低级别SCAs中经常被发现，包括BRAF、KRAS和NF1突变，而H3F3A^K27M和TP53突变是高级别SCAs中最常见的改变。

为了进一步表征SCAs的基因组突变图，并对这种罕见疾病的生物学提供更深入的见解。2023年4月28日发表在JOURNAL OF PATHOLOGY上的文章使用全外显子组测序(WES)对SCAs进行了深入而全面的基因组分析。

51例原发性SCA的体细胞改变景观

研究人员利用WES分析了51个原发性SCA的体细胞核苷酸变异(SNVs)和拷贝数变异(CNVs)，使用四种算法搜索驱动基因，通过GISTIC2检测显著的CNVs。通过对结果进行总结，得到了反复突变的途径和12个驱动基因。其中，H3F3A(47.1%)、TP53(29.4%)、NF1(19.6%)、ATRX(17.6%)和PPM1D(17.6%)是最常见的突变基因。

并且在胶质瘤中发现了三个新的驱动基因HNRNPC、SYNE1和RBM10，和几种种系突变，包括三种变异(SLC16A8 rs2235573, LMF1 rs3751667, FAM20C rs774848096)，与脑胶质瘤的风险相关。

此外，在SCA中发现包含癌基因CDK4的12q14.1(13.7%)反复扩增，对患者预后产生负面影响。除了RTK/RAS通路和PI3K通路常发生突变外，39.2%的患者发生视网膜母细胞瘤蛋白(retinoblastoma protein, RB)磷酸化的细胞周期通路突变。

综上所述，SCAs和脑干胶质瘤之间有相当程度的体细胞突变。研究人员的工作为原发性SCAs的分子图谱提供了关键的见解，作为代表候选药物靶点并补充胶质瘤的分子图谱。

但该研究存在一些局限性。首先由于这种疾病的罕见性，本研究的样本量相对较小。其次，由于缺乏足够的组织质量/数量以及无法获得匹配的肿瘤周围组织，因此未进行多组学分析，包括表观基因组学和转录组学分析。除此之外，审查数据的高比率降低了检测某些改变与生存结果之间相关性的能力。尽管如此，我们的观察对于产生可以在未来研究中探索的假设是重要的。

原始出处

Cheng, L., Zhang, F., Zhao, X., Wang, L., Duan, W., Guan, J., Wang, K., Liu, Z., Wang, X., Wang, Z., Wu, H., Chen, Z., Teng, L., Li, Y., Xiao, F., Fan, T. and Jian, F. (2023), Mutational landscape of primary spinal cord astrocytoma. J. Pathol.. https://doi.org/10.1002/path.6084