肺动脉高压中m7G甲基化修饰模式和肺血管免疫微环境的分析
时间：2022-12-28 17:59:40 热度：37.1℃ 作者：网络
研究背景：
M7G甲基化修饰在心血管疾病的发展中起着重要作用。免疫微环境的失调与PAH的发病机制密切相关。然而，m7G甲基化是否通过影响免疫微环境而参与PAH的进展，目前尚不清楚。
研究方法：
从GEO数据库中获得PAH的基因表达谱，并分析m7G调控因子的差异。采用机器学习算法筛选特征基因，包括最小绝对收缩和选择算子、随机森林和支持向量机递归特征消除分析。构建了一个提名图模型，并使用接收器操作特征来评估疾病特征基因的诊断值。接下来，我们使用无监督聚类方法，对m7G差异基因进行一致性聚类分析。使用ssGSEA算法估计PAH中m7G调节器与免疫细胞浸润之间的关系，并分析与疾病特征基因的相关性。最后，通过筛选的特征基因对所列药物进行评估。
研究结果：
我们确定了15种m7G的差异基因。通过机器学习算法确定CYFIP1、EIF4E和IFIT5为标志性基因。同时，通过共识聚类确定了两种m7G分子亚型（A/B群）。此外，免疫细胞浸润分析显示，活化的CD4 T细胞、调节性T细胞和2型T辅助细胞在m7G簇B中上调，CD56暗淡的自然杀伤细胞、MDSC和单核细胞在m7G簇A中上调。 这可能有助于选择Calpain抑制剂I和Everolimus治疗PAH。
研究结论：
我们的研究发现CYFIP1、EIF4E和IFIT5是PAH的新型诊断生物标志物。此外，它们与免疫细胞浸润的关系可能会促进PAH的免疫治疗的发展。
参考文献：
Wang D, Mo Y, Zhang D, Bai Y. Analysis of m7G methylation modification patterns and pulmonary vascular immune microenvironment in pulmonary arterial hypertension. Front Immunol. 2022 Dec 5;13:1014509. doi: 10.3389/fimmu.2022.1014509. PMID: 36544768; PMCID: PMC9762157.
