谁也不会想到，拜仁慕尼黑客场与法兰克福的比赛，竟然最终会踢出一个1-5的惨败。比赛中，拜仁球员状态低迷，主帅科瓦奇在场边也是束手无策。赛后，来自德国《图片报》的劲爆消息，原本在赛前，科瓦奇准备把首发的穆勒从首发名单中撤下，后来在周围人（主要是助教弗里克和他弟弟罗伯特-科瓦奇）的劝阻下，克罗地亚教头才作罢……

周中的德国杯第二轮，穆勒替补登场完成救赎，他在最后时刻的进球，帮助拜仁勉强2-1逆转波鸿晋级16强。完成压哨球之后，媒体对拜仁队副的声援达到了顶峰，逼着科瓦奇不得不在本轮德甲将穆勒重新放入首发名单。而且，此役对于穆勒还有一个特殊的意义，这是他拜仁生涯的整整第500场比赛。

可惜，在这场里程碑战役中，穆勒表现平平，在第64分钟被马丁内斯早早换下，本赛季德甲进行了10轮，这位拜仁前锋依然颗粒无收，遭遇着德甲进球荒。而且，在比赛中，科瓦奇不断喊着穆勒的名字，“托马斯、托马斯……”的声音回想在法兰克福商业银行竞技场内。不知情的人还觉得拜仁全队表现低迷，为什么科瓦奇偏偏“揪着”穆勒不放，一直要求他回防，要求他多回撤拿球。事实上，穆勒在比赛中还是比较积极的，尽管效果不算理想。

来自《图片报》的消息，科瓦奇此役对于穆勒的“怨念”源于赛前，穆勒热身前在通道里“慢悠悠地溜达”，嘴里还吹着口哨，全然没有任何紧迫感和压力感，感觉这场比赛还没踢似乎已经十拿九稳。虽然不知道拜仁其他球员的心态，但副队长的态度显然很容易影响周围的队员。对此，科瓦奇感到非常愤怒，差点要一怒之下换掉穆勒。虽然最终还是让穆勒首发，但穆勒仅仅踢了1个小时便被换下，在自己的500场里程碑战役中碌碌无为。