新冠病毒肆虐全球已有一年半的时间，随着人们对新冠病毒的深入了解，新冠病例的治愈康复率在不断提高，不过，其康复后的后遗症也应该受到重视。曾发表在 Nature 的一篇文献指出，多数COVID-19康复者面临着众多健康问题，新冠病毒不仅仅影响着呼吸道系统，还可能长期影响着神经系统、代谢系统、心血管系统、胃肠道系统、凝血调节、肌肉骨骼系统以及总体身体健康状况等。

那么，儿童在感染新冠后，是否也会出现上述类似的后遗症？来自复旦大学、中科院与云南大学的联合研究团队对此进行了研究，并在 Journal of Genetics and Genomics 上发表了题目为 Progressive deterioration of the upper respiratory tract and the gut microbiomes in children during the early infection stages of COVID-19 的文章。该篇文章研究了COVID-19患儿呼吸道与肠道微生物菌群的动态变化，从而揭示了新冠病毒对康复儿童的后续影响。

这项研究采取了对照试验的方式，将COVID-19患儿与健康儿童分为两组进行样本数据采集，其中，COVID-19患儿组由9名7-139个月大、曾感染新冠病毒的儿童组成，健康组则由14名相同年龄段、未感染新冠病毒的健康儿童组成。试验共收集了两组儿童共103份COVID-19标本，其中包括27组成对的咽拭子、鼻拭子或粪便标本，并对这些样本进行了高通量测序。同时，研究人员对患儿组的儿童在感染新冠出现症状后进行了为期25-58天的随访。

首先，研究人员对比了患儿组与健康组在咽喉、鼻腔以及肠道三个部位的微生物菌群多样性。数据显示，两组样本具有不同的微生物菌群组成特征，例如，类杆菌和厚壁菌在COVID-19患儿的肠道内显著富集，而健康组的肠道中富集的则是蛋白质细菌；在上呼吸道中，健康组显示了类杆菌和厚壁菌的富集，而COVID-19患儿组则富含变形杆菌。

在对各微生物菌群丰度进行了进一步分析后，研究结果显示，患儿组的上呼吸道和肠道中共栖菌的丰度显著增高，而健康组的致病菌和环境细菌丰度显著增高，这些结果表明，新冠病毒的感染会改变儿童上呼吸道和肠道的微生物菌群组成。