从生物数据到临床分析——冠科生物的一站式科研服务

时间:2022-04-07 11:13:37   热度:37.1℃   作者:网络

工欲善其事,必先利其器。一项好的研究必然离不开好的实验技术,时至今日,各种新技术新方法如同雨后春笋般冒出来,让许多科研人员都产生了一种“错觉”:没有新技术新方法就很难做出突破性的研究。

诚然,新的技术方法是我们完成创新研究的重要保障,但从不断涌现的高分文章中我们也能看到更多传统研究方法的影子。就如同肿瘤学的分子鉴定如火如荼,但是临床上确诊肿瘤的金标准仍然是传统的病理学鉴定技术。分子生物学的飞速发展也让我们从细胞尺度跨进基因的分子尺度,然而日渐更新的种种基因组学方法虽然给我们提供了研究的便利,但传统的流式细胞术仍然是许多组学文章绕不开的经典方法。经过我们对大量2021年高分文章中实验方法的总结可以发现:流式细胞术,病理学技术和基因组学仍然是目前最为流行的几种研究方法,可以说是我们打开科学项目研究的金标准。

3月17日,北京大学的张泽民老师课题组在Cell子刊Cancer Cell上发表了题为《Immune phenotypic linkage between colorectal cancer and liver metastasis》的最新研究论文。这篇研究论文使用了最新的单细胞转录组测序技术对结直肠癌原位和肝转移之间的免疫细胞表型进行了研究,可以说是一项技术超前的研究论文。但是,从这篇文章中我们可以发现,尽管文章里通过最新的测序技术对肿瘤内部的各类免疫细胞进行了解析,但是对于测序结果的验证仍然要回归传统的流式细胞术和病理学技术。这篇文章的这种组学+流式细胞术+病理学验证的三合一方法也正是近年来许多研究肿瘤的高分文章的惯用方法。而组学技术层出不穷,从低级到高级的不用组学技术搭配我们传统的流式细胞术和病理学技术便可以完成一篇优秀的研究论文。这种思路为我们开展研究打开了一扇广阔的大门。

近年来,国内各类生物公司遍地开花,无论规模大小都或多或少提供了基因组学、流式细胞术和病理学技术的技术服务。然而,相伴而来的是服务质量的良莠不齐,许多科研人员都苦恼于没有一家价格合适,服务优良的公司来提供一站式科研服务。为了解决上述科研人员的痛点问题,冠科生物结合自身在全球生物医药行业深耕多年的技术积累推出了横跨分子尺度的基因组学分析、细胞尺度的流式细胞术分析和组织尺度的数字病理学技术于一身的“一站式跨尺度综合性科研服务平台”,该平台可以为肿瘤学、免疫学、免疫介导的炎症性疾病研究和新药开发等方向的研究人员提供强最为有力的技术支撑。

流式细胞术经过半个世纪的发展,作为一种最为常用的免疫学方法而被广泛使用。许多实验室甚至都已经配备了小型的流式细胞仪,然而专业性和经验性的不足使得更多时候研究人员“望仪生叹”。冠科生物作为一家横跨全球的生物医药公司,在流式细胞术方面不仅配备了先进齐全的多达17色的BD公司最新款流式细胞仪,更积累了丰富的检测各类免疫表型的成功经验。冠科生物流式平台提供的高质量优化的圈门策略,荧光补偿的精准设置,专业流式专家的全程指导,云端报告的一键可及可以为广大研究者提供如肿瘤、血液、脾脏、淋巴结等相关器官的免疫组成检测、细胞亚群频率和功能检测、和个体样本变异和反应异质性检测等复杂的免疫学检测服务。同时,结合每位研究者的个性化需求,冠科生物的流式专家团队还可以提供个性化的流式检测方案,为研究人员提供个性化的一站式流式检测服务。

BD LSRFORTESSATM流式细胞仪

病理学检测技术是目前临床研究使用最为成熟广泛的技术之一。然而,随着肿瘤发病率和病理检测需求的指数化增加,传统的病理学检测方法已经难以适用大样本的病理学分析研究;此外,市场上提供病理学检测的公司良莠不齐,很难为研究人员提供一致性较好的高质量病理学检测服务。为了解决这些痛点问题,冠科生物在传统病理学检测的基础上结合先进的计算机技术开发了数字化的病理学平台。该平台在完整病理学技术链条的基础上,拓展了超过400个生物标志物可供选择,同时具有高通量的自动染色系统以及高分辨率的全切片数字病理图像处理系统和自动化分析系统,自动化和标准化的图像数据获取和处理大大降低人为操作和主观性的影响,并有力保证了病理学信息的准确性,加速对肿瘤研究好新药开发的认知与了解。通过该平台,研究人员可以实现:(1)在适当的组织学背景下,准确地显示特定细胞成分的空间分布和定位及其相互之前的潜在关系;(2)通过检测疾病标志物在靶组织和其他器官或组分的特异性表达以及表达水平来评估药物疗效和潜在毒性;(3)准确定位肿瘤组织中的作用靶点;(4)加速肿瘤微环境和异质性相关药物研究与开发;(5)提高您的药物获得临床前和临床成功的可能性。

分子生物学的发展让基因组学研究得以进入科研人员的视线。近年来从二维到三维,从低通量到高通量的基因组学方法拓展更是让基因组学的发展一日千里,也让越多越多的科研人员得以使用这一利器开展项目研究。冠科生物多年来在常规基因组学分析上积累了丰富的全球项目经验,并在此基础上引进了多个二代、三代测序平台,为客户提供基因组学分析的全方位解决方案。既可以为客户提供包括基因突变、基因融合、基因表达等基于PCR/qPCR,Sanger测序等传统检测服务;同时也可以通过MGISEQ,Illumina,PacBio和Bionano等技术平台,提供基于高通量测序技术的全基因组层面解决方案,可以为客户提供全基因组测序分析、全基因组甲基化分析、转录组分析、全外显子组分析、微生物学服务(包括宏基因组分析、宏转录组分析、16S全长序列分析等)、全基因组染色体结构变异分析等服务。基于最新的测序平台和多年的技术积累,冠科生物在基因组学领域做到了“人无我有,人有我新”的技术保障,并通过特色化的高通量测序分析如小鼠肿瘤免疫基因检测、基于深度测序的的细胞系和生物样本鉴定赢得了市场的一致认可。此外,自动化,标准化和特色化的服务也是冠科生物基因组学平台获取稳定高质量生物数据的重要保障。

基因-高通量自动化样本制备系统960RS

基因-建库工作站PE

基因测序仪NovaSeq 6000

基因测序仪MGISEQ-2000RS

时至今日,基因组学结合流式细胞术和病理学分析已经成为临床研究的重要技术路线。而冠科生物作为一家为肿瘤学、免疫肿瘤学和免疫介导的炎症性疾病研究提供服务的尖端药物发现和开发服务公司,在年均发表50多篇研究论文的基础上积累了大量的项目经验,并借此建立了基因组学平台,流式细胞术平台和病理学分析平台。三个平台在传统技术的基础上结合最新的仪器和技术方向发展,致力于为广大研究人员提供更加具有一致性的高质量生物数据,并为临床转化提供最为坚实的技术支撑和服务。

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